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「輝駿客戶文章」Adv Sci ( IF=14.1 )|RNA pull down試劑盒助力WTAP介導(dǎo)的m6A修飾促食管鱗癌機制研究
發(fā)布時間:2025-08-07 14:32:37作者:輝駿生物-fitgene

2025年6月5日,皖南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院朱少金教授南京醫(yī)科大學(xué)附屬無錫人民醫(yī)院毛文君教授團隊共同合作,在Advanced ScienceIF=14.1)發(fā)表了題為“WTAP Mediated m6A Modification Stabilizes PDIA3P1 and Promotes Tumor Progression Driven by Histone Lactylation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma”的研究論文。


非常榮幸,輝駿生物產(chǎn)品生物素RNA pull down試劑盒(貨號:FI8702)、F2-RNA pull down試劑盒(貨號:FI8701),助該研究一臂之力。


輝駿生物RNA pulldown試劑盒客戶文獻(xiàn).png
01

究摘要


食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)是一種常見的消化道惡性腫瘤,發(fā)病率高,死亡率高。許多研究表明,長鏈非編碼RNAlncRNAs參與了各種類型腫瘤的發(fā)展。lncRNA PDIA3P1促進(jìn)ESCC的進(jìn)展,但其背后的分子機制尚不清楚。


作者研究發(fā)現(xiàn),lncRNA PDIA3P1在ESCC中高度表達(dá)。它可作為miRNA海綿吸附"miR-152-3p",進(jìn)而降低GLUT1(葡萄糖轉(zhuǎn)運體1)的 mRNA水平;它還通過結(jié)合下游靶點HK2(己糖激酶2)來阻礙其泛素化降解,促進(jìn)糖酵解。高度活躍的糖酵解產(chǎn)生更多乳酸,進(jìn)而上調(diào)組蛋白H4K8乳酸化(H4K8la)水平,促進(jìn)BMP7(靶基因骨形態(tài)發(fā)生蛋白7)的轉(zhuǎn)錄,從而推動腫瘤進(jìn)展。此外,WTAP介導(dǎo)的m6A修飾通過IGF2BP1依賴性識別來增強PDIA3P1的穩(wěn)定性。


02

究思路

研究發(fā)現(xiàn)lncRNA“PDIA3P1”在ESCC組織及細(xì)胞系中高表達(dá)RNA-seq結(jié)果揭示其與糖酵解相關(guān)。


生物信息學(xué)分析了靶向PDIA3P1的5種miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR實驗證實miR-152-3p的富集最為顯著,研究者使用輝駿生物“生物素RNA pull down試劑盒”進(jìn)行miRNA pull down實驗,發(fā)現(xiàn)PDIA3P1可以結(jié)合miR-152-3p(圖1K)。

圖1.jpg

1 PDIA3P1作為miR-152-3p的海綿調(diào)節(jié)GLUT1的表達(dá)


PDIA3P1敲低顯著下調(diào)了糖酵解關(guān)鍵酶:GLUT1和HK2的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶點。


機制解析發(fā)現(xiàn),一方面,PDIA3P1通過競爭結(jié)合miR-152-3p,減少其對GLUT1 mRNA的降解,從而維持GLUT1的穩(wěn)定性和表達(dá)水平,另一方面,PDIA3P1直接結(jié)合HK2,阻斷E3泛素連接酶MARCH8對HK2的泛素化降解,提高其蛋白穩(wěn)定性。這兩方面共同激活了糖酵解關(guān)鍵節(jié)點,加速了乳酸的積累。


CUT&Tag和RNA-seq實驗篩選出了H4K8la的潛在靶基因BMP7(骨形態(tài)發(fā)生蛋白7),功能驗證實驗發(fā)現(xiàn),BMP7是PDIA3P1驅(qū)動ESCC進(jìn)展的下游靶點,調(diào)控ESCC的腫瘤進(jìn)展。


此前研究發(fā)現(xiàn)其他癌癥中PDIA3P1出現(xiàn)了大量的m6A富集峰;SRAMP預(yù)測MeRIP-qPCR顯示、TCGA數(shù)據(jù)庫分析、qRT-PCR實驗發(fā)現(xiàn)PDIA3P1在ESCC中存在顯著的m6A修飾,并且其表達(dá)水平與m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP呈正相關(guān)。


研究者使用輝駿生物“F2-RNA pull down試劑盒”證實,PDIA3P1與WTAP之間存在直接相互作用(圖2H,I),WTAP通過m6A修飾調(diào)控PDIA3P1的RNA穩(wěn)定性,且m6A閱讀器IGF2BP1是穩(wěn)定PDIA3P1的關(guān)鍵因子,WTAP/IGF2BP1依賴的m6A修飾是PDIA3P1高表達(dá)的關(guān)鍵機制。

PDIA3P1穩(wěn)定性增強源于IGF2BP1對WTAP介導(dǎo)的m6A修飾的識別

圖2 PDIA3P1穩(wěn)定性增強源于IGF2BP1對WTAP介導(dǎo)的m6A修飾的識別


綜上所述,研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作為代謝-表觀調(diào)控樞紐的重要功能:一方面通過ceRNA機制和蛋白互作增強糖酵解,誘導(dǎo)乳酸依賴的組蛋白乳酰化,促進(jìn)BMP7轉(zhuǎn)錄;另一方面通過WTAP/IGF2BP1介導(dǎo)的m6A修飾維持自身穩(wěn)定性和表達(dá)水平。這一發(fā)現(xiàn)不僅拓展了對ESCC發(fā)病機制的認(rèn)識,也為靶向代謝重編程與表觀修飾的聯(lián)合治療策略提供了新靶點。


  使用產(chǎn)品:
生物素RNA pull down、F2-RNA pull down試劑盒(由輝駿生物提供產(chǎn)品和技術(shù)支持)


03

產(chǎn)品介紹

產(chǎn)品信息

貨號

產(chǎn)品名稱

FI8701

F2-RNA pull down Kit專利產(chǎn)品

FI8702

Biotin-Labeled RNA pull down Kit


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實驗服務(wù)


服務(wù)項目

服務(wù)內(nèi)容

F2-RNA pull down

制備RNA正義鏈和反義鏈探針、Western blot檢測樣本中的待測蛋白、RNA pull down捕獲目標(biāo)RNA及其結(jié)合蛋白

miRNA pull down qPCR

合成生物素miRNA探針、qPCR檢測樣本中的待測靶RNA、miRNA pull down捕獲miRNA-靶RNA復(fù)合體并檢測(實驗組、對照組)


04

服務(wù)優(yōu)勢

01

十年服務(wù)經(jīng)驗,客戶成果發(fā)表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。

02

對圍繞RNA結(jié)合蛋白開展的整體課題提供全方位指導(dǎo),包括上下游實驗設(shè)計和結(jié)合蛋白的多方法驗證等。

03

自有蛋白質(zhì)組學(xué)平臺,對RNA pull down產(chǎn)物這類微量蛋白的質(zhì)譜鑒定有十足的把控能力,對后續(xù)的生物信息分析有獨到的見解。

04

售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章,確??蛻舭残倪M(jìn)行下游實驗及投稿。



輝駿生物,10年專注分子互作和蛋白研究,專業(yè)提供蛋白、核酸互作產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)。輝駿自有蛋白質(zhì)檢測平臺,擅長互作產(chǎn)物等微量蛋白的質(zhì)譜鑒定及生物信息分


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