免疫共沉淀(Co-IP)* 實(shí)驗(yàn)原理
結(jié)合了抗體的磁珠或樹脂(Beads)與樣本裂解液孵育,通過”抗原-抗體“之間的免疫作用,誘餌蛋白被吸附在Beads上,與此同時(shí),誘餌蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗滌去掉未結(jié)合的蛋白后,再用洗脫緩沖液將互作蛋白復(fù)合物從Beads上洗脫下來,得到免疫共沉淀(Co-IP)產(chǎn)物。Co-IP產(chǎn)物既可以用Western Blot檢測已知蛋白,也可以用質(zhì)譜鑒定未知蛋白。
當(dāng)沒有合適的誘餌蛋白抗體時(shí),還可以通過表達(dá)融合了Flag標(biāo)簽的誘餌蛋白,利用Flag標(biāo)簽抗體做免疫沉淀。即樣本過表達(dá)Flag-Bait,經(jīng)裂解后與anti-Flag珠子孵育,誘餌融合蛋白與Beads結(jié)合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再經(jīng)洗滌、洗脫后,用WB或質(zhì)譜檢測。
CoIP實(shí)驗(yàn)原理+實(shí)操+結(jié)果解讀+文獻(xiàn)解析—輝駿生物CoIP視頻全攻略
輝駿生物10年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),專業(yè)提供分子互作實(shí)驗(yàn)服務(wù),包括蛋白與蛋白、蛋白與DNA、蛋白與RNA、RNA與RNA的相互作用技術(shù),經(jīng)驗(yàn)豐富,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定、可靠。
我公司自有分子、細(xì)胞和質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)平臺(tái),能執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線,對(duì)微量互作蛋白的質(zhì)譜鑒定有充足把控力,對(duì)后續(xù)功能分析有獨(dú)到見解。
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免疫共沉淀(Co-IP)* 實(shí)驗(yàn)流程

內(nèi)源蛋白抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)步驟

標(biāo)簽抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)流程
免疫共沉淀(Co-IP)* 應(yīng)用背景
蛋白質(zhì)之間相互作用是其發(fā)揮生物學(xué)功能的主要模式,蛋白質(zhì)會(huì)通過結(jié)合不同的伙伴來行駛不同的功能,形成復(fù)雜的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。常見的蛋白互作研究方法主要有:免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、酵母雙雜交、熒光雙分子互補(bǔ)(BiFC)、熒光共定位等。這些方法相互補(bǔ)充,通過多種方法共同驗(yàn)證蛋白質(zhì)間的相互作用,能更大程度的避免假陽性結(jié)果。
Co-IP技術(shù)采用抗體捕獲樣本中的目標(biāo)蛋白及其互作蛋白復(fù)合物,反應(yīng)的是體內(nèi)真實(shí)的生理結(jié)合,但不能顯示這些相互作用是直接還是間接的;另外合適的免疫共沉淀抗體是決定實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵,有些蛋白沒有合適的IP抗體,無法進(jìn)行內(nèi)源性Co-IP實(shí)驗(yàn);通過構(gòu)建帶標(biāo)簽的表達(dá)載體,使目標(biāo)蛋白與標(biāo)簽融合表達(dá),再借助標(biāo)簽抗體即可完成Co-IP實(shí)驗(yàn),但需要注意合適的轉(zhuǎn)基因方法又是影響該方法成功的關(guān)鍵。
pull down技術(shù)將目標(biāo)蛋白進(jìn)行體外原核表達(dá),使標(biāo)簽蛋白(GST或His等)與目標(biāo)蛋白融合表達(dá),借助標(biāo)簽的親和介質(zhì)將目標(biāo)蛋白純化出來,可以不受抗體、物種限制,比較輕松的獲得目標(biāo)蛋白的結(jié)合蛋白,還可以通過外源同時(shí)表達(dá)目標(biāo)蛋白和待測蛋白,確定它們是否發(fā)生直接的相互作用,但該方法無法得知體內(nèi)真實(shí)的結(jié)合情況。
酵母雙雜交技術(shù)是比較古老的一種技術(shù),將目標(biāo)蛋白和待測蛋白與GAL4
的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域BD和AD融合表達(dá),在酵母細(xì)胞中,2個(gè)蛋白的結(jié)合使得BD和AD在空間上靠近,從而激活報(bào)告基因lacZ的表達(dá)。但是由于受試蛋白都需要和
AD/BD 結(jié)構(gòu)域形成融合蛋白,空間構(gòu)象可能改變;另外假陽性率也比較高。
熒光雙分子互補(bǔ)(BiFC)技術(shù)將目標(biāo)蛋白和待測蛋白分別與GFP的兩個(gè)片段融合表達(dá),轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,2個(gè)蛋白的結(jié)合使得GFP兩個(gè)片段空間上靠近,從而發(fā)出綠色熒光,該技術(shù)觀測直觀,操作簡便,但空間分辨率大約
250nm,對(duì)于蛋白質(zhì)相互作用來說依然是個(gè)相當(dāng)遠(yuǎn)的距離,因此位置上靠近但并未結(jié)合的蛋白也可能顯示陽性結(jié)果,假陽性率較高;另外該技術(shù)可以驗(yàn)證蛋白間的相互作用,但不能篩選未知互作蛋白。
熒光共定位技術(shù)依靠熒光確定蛋白質(zhì)具有相同定位,用于輔助證明而非直接證明細(xì)胞內(nèi)蛋白間的相互作用。
免疫共沉淀Co-IP * 輝駿服務(wù)內(nèi)容
服務(wù)項(xiàng)目
| 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 客戶提供
| 價(jià)格
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Co-IP WB (驗(yàn)證型) | 樣本質(zhì)檢 (Western blot檢測誘餌蛋白和待測蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 樣本的待測蛋白Western blot檢測圖 | 3-4周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 待測蛋白抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 |
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Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測圖
IP產(chǎn)物的待測蛋白Western blot檢測圖 CoIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 |
Co-IP MS (篩選型) | 樣本質(zhì)檢(Western blot檢測誘餌蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 | 5-6周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 |
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Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測圖
CoIP實(shí)驗(yàn)服務(wù)報(bào)告 |
| IP產(chǎn)物的質(zhì)譜檢測及數(shù)據(jù)分析 | 質(zhì)譜(LC-MS/MS)檢測結(jié)果及報(bào)告 互作蛋白篩選表格 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報(bào)告 |
免疫共沉淀CoIP * 樣本要求
樣本類型
| COIP-WB 建議送樣量 | COIP-MS 建議送樣量 |
| 動(dòng)物細(xì)胞 | 3*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約3個(gè)10cm皿) | 5*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約5個(gè)10cm皿) |
| 動(dòng)物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
| 植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
| 植物根或果實(shí) | 4g/組
| 8g/組 |
| 菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實(shí)驗(yàn)和對(duì)照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細(xì)送樣指南可聯(lián)系輝駿生物客服或銷售索取。
保存及運(yùn)輸:-80℃保存,干冰取樣/運(yùn)輸,至少在送樣前2天通知我司。
免疫共沉淀Co-IP * 結(jié)果示例

Co-IP WB:誘餌蛋白和待測蛋白Western blot檢測圖(陽性)

Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測圖

Co-IP MS:質(zhì)譜檢索表格(部分展示)

Co-IP MS:互作蛋白生信分析結(jié)果(部分展示)
免疫共沉淀(Co-IP)服務(wù)案例—客戶文章解析
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research. 2019. (中科院1區(qū),IF=13.312).
膽固醇通過APMAP抑制EGFR降解誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移
研究概述
轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報(bào)道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān);前期研究發(fā)現(xiàn),膽固醇可以誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),但其作用及潛在機(jī)制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導(dǎo)APMAP上調(diào),APMAP通過與EGFR競爭結(jié)合EPS15R,進(jìn)而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。

研究路線
細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)證實(shí)膽醇誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞EMT的發(fā)生依賴于ERK1/2的激活RNA-seq、蛋白組學(xué)等實(shí)驗(yàn)篩選和驗(yàn)證與膽固醇有關(guān)的差異基因和蛋白,確定ERK1/2的上游凋節(jié)因子“ APMAI和“"EGFR”作為后續(xù)研究目標(biāo)APMAP基因敵除后的RNA-seq結(jié)果及其細(xì)胞實(shí)驗(yàn)均顯示APMAP和膽固醇可能有相似的功能APMAP和EGFR的表達(dá)關(guān)系實(shí)驗(yàn)表明 APMAP通過調(diào)節(jié)EGFR參與膽固醇誘導(dǎo)的EMT過程免疫共沉淀Co-IP結(jié)合質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)找到 APMAP的互作蛋白EPS15R免疫熒光結(jié)果顯示膽固醇誘導(dǎo)使EPS15R和APMAP的作用增強(qiáng),EPS15R與EGFR解離,進(jìn)而抑制EGFR降解臨床樣本分析APMAP與前列腺癌的關(guān)系
免疫共沉淀(Co-IP) * 客戶文章