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IP是在已知一種蛋白質的抗體情況下，直接用這種抗體將目標蛋白質提取出來，是一種提純蛋白質的方法。

免疫共沉淀（CoIP）主要用于檢測蛋白質與蛋白質之間連接作用，如你想檢測蛋白質A與蛋白質B之間是否有相互作用，你手中又有蛋白質A的特異抗體，就將蛋白質A和抗體加入到含有蛋白質B的細胞解液中去，利用抗體提純，如果蛋白質A，B之間有相互作用，則最后提純產物是抗體——蛋白質A——蛋白質B。由于最后終產物是多種蛋白質復合物，所以這種技術叫做co-immunoprecipitation，和IP的用途區(qū)別還是很大的。