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環(huán)狀RNA hsa-circ-0004872作為miR-224海綿抑制胃癌發(fā)展
發(fā)布時(shí)間:2020-12-18 11:27:55作者:輝駿生物

標(biāo)題:Circular RNA hsa-circ-0004872 inhibits gastric cancer progression via the miR-224/Smad4/ADAR1 successive regulatory circuit.

期刊:Molecular Cancer

影響因子:10.679

關(guān)鍵詞:circRNA,miRNA,miR-224,hsa-circ-0004872,p21,Smad4,ADAR1,胃癌


主要技術(shù)方法:circRNA測序,RNA免疫共沉淀(RIP-qPCR)染色免疫共沉淀(ChIP-qPCR),雙熒光素酶報(bào)告基因檢測,細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和小鼠實(shí)驗(yàn)等。


胃癌是最常見的惡性腫瘤之一,在癌癥致死率方面排名第三,由于復(fù)發(fā)率高和轉(zhuǎn)移,胃癌患者的預(yù)后很差。越來越多的研究表明,環(huán)狀RNA(CircRNA)在癌癥的發(fā)生和發(fā)展中起重要的調(diào)節(jié)作用,探索胃癌中circRNA的表達(dá)情況和作用機(jī)制將有助于尋找新的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),對提高胃癌患者的生存率至關(guān)重要。


2020年11月,山東大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)在胃癌中顯著下調(diào)的circRNA——hsa-circ-0004872,其表達(dá)水平與腫瘤大小和局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)。hsa-circ-0004872作為miR-224 的“分子海綿”來上調(diào)miR-224靶標(biāo)p21和Smad4的表達(dá),其本身受到RNA編輯酶ADAR1的抑制,miR-224靶標(biāo)Smad4又可以結(jié)合ADAR1的啟動子并抑制其表達(dá),從而正反饋調(diào)控hsa_circ_0004872的水平。該發(fā)現(xiàn)可能為胃癌的診斷和治療提供新的思路和靶點(diǎn)。


環(huán)狀RNA hsa-circ-0004872作為miR-224海綿抑制胃癌發(fā)展.png


1.    胃癌中低表達(dá)的hsa-circ-0004872可以抑制胃癌細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移
研究者采用circRNA測序分析了胃癌和癌旁組織中的差異表達(dá)circRNA,并在42對臨床樣本中做了qPCR驗(yàn)證,最終選擇在胃癌組織中下調(diào)最顯著的hsa-circ-0004872作為研究目標(biāo)。Sanger測序、發(fā)散引物擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)確認(rèn)了胃癌中hsa-circ-0004872的存在,進(jìn)一步的臨床樣本分析表明,hsa-circ-0004872的表達(dá)水平與胃癌進(jìn)程和腫瘤大小有關(guān)。RNase R處理、Northern blot檢測和轉(zhuǎn)錄抑制劑ActD處理實(shí)驗(yàn)確定了hsa_circ_0004872具有比線性RNA更好的穩(wěn)定性。EdU、CCK-8、傷口愈合和transwell等細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明,hsa_circ_0004872可以抑制胃癌細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移,干擾hsa_circ_0004872后即有相反的效果。


2.    hsa-circ-0004872與miR-224相互作用
由于FISH檢測發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0004872定位于細(xì)胞質(zhì)中,因此推測它可能作為“miRNA海綿”發(fā)揮作用。AGO2抗體的RNA免疫共沉淀(RIP)可以富集到hsa_circ_0004872,表明其通過AGO2與miRNAs結(jié)合。接下來,數(shù)據(jù)庫預(yù)測了hsa_circ_0004872的潛在靶miRNAs,發(fā)現(xiàn)只有hsa-miR-224(miR-224)具有致癌功能。RNA pull-down和雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)均表明hsa_circ_0004872與miR-224相互作用。


3.    hsa-circ-0004872通過miR-224上調(diào)其靶標(biāo)p21和Smad4的表達(dá)
過表達(dá)/干擾和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明miR-224促進(jìn)胃癌的細(xì)胞增殖、侵襲和遷移。為了確定miR-244在胃癌細(xì)胞中的靶基因,作者查找文獻(xiàn)并進(jìn)行了WB檢測和雙熒光素酶實(shí)驗(yàn),確定了其中2個靶基因“p21”和“Smad4”。之后檢測了hsa_circ_0004872對Smad4和p21表達(dá)的影響,發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0004872的水平與胃癌細(xì)胞中的Smad4和p21蛋白水平呈正相關(guān)。功能回補(bǔ)實(shí)驗(yàn)表明,hsa_circ_0004872至少部分通過miR-224抑制GC的增殖、侵襲和遷移。


4.    hsa_circ_0004872抑制體內(nèi)腫瘤生長和轉(zhuǎn)移
hsa_circ_0004872過表達(dá)胃癌細(xì)胞和對照細(xì)胞通過皮下注射和尾靜脈注射的方式導(dǎo)入小鼠體內(nèi),hsa_circ_0004872過表達(dá)組形成的腫瘤平均體積遠(yuǎn)小于對照組,HE染色顯示所有腫瘤均為實(shí)體瘤,qRT-PCR分析表明,過表達(dá)組腫瘤中hsa_circ_0004872的水平高,而miR-224的水平低。IHC結(jié)果顯示過表達(dá)組腫瘤中p21和Smad4的表達(dá)增加;此外,過表達(dá)組小鼠肺表面的轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)明顯小于且少于對照組。說明hsa_circ_0004872有效地抑制了體內(nèi)腫瘤的生長和轉(zhuǎn)移。


5.    hsa_circ_0004872受RNA編輯酶ADAR1調(diào)節(jié)
circRNA的形成受到核糖核酸結(jié)合蛋白的調(diào)控,通過查找基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)只有RNA編輯酶ADAR1在胃癌組織中的表達(dá)顯著高于非腫瘤組織,qPCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了這一結(jié)果。數(shù)據(jù)庫分析表明,胃癌組織中ADAR1的高表達(dá)與生存期較短有關(guān)。ADAR1過表達(dá)/干擾實(shí)驗(yàn)確定了ADAR1蛋白對hsa_circ_0004872有抑制作用。功能回補(bǔ)實(shí)驗(yàn)表明,ADAR1干擾導(dǎo)致的miR-224下調(diào)被hsa_circ_0004872 siRNA部分逆轉(zhuǎn),表明ADAR1通過hsa_circ_0004872調(diào)節(jié)miR-224的表達(dá)。


6.    Smad4通過ADAR1調(diào)節(jié)hsa_circ_0004872水平
由于miR-224的靶基因Smad4是一種轉(zhuǎn)錄因子,因此研究了其是否可以反饋調(diào)節(jié)ADAR1的水平。預(yù)測結(jié)果顯示,ADAR1啟動子區(qū)域存在Smad4結(jié)合位點(diǎn),ChIP實(shí)驗(yàn)確定了Smad4可以直接與ADAR1啟動子區(qū)域結(jié)合。進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)表明,Smad4過表達(dá)導(dǎo)致了ADAR1蛋白和mRNA水平顯著下調(diào),hsa_circ_0004872水平上調(diào)。雙熒光素酶也再次證明了Smad4過表達(dá)降低了ADAR1的啟動子活性。


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