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客戶文章技術(shù)專題問題答疑
互作文章蛋白文章分子細(xì)胞文章分子互作試劑盒文章
Huang T. et al: WTAP Mediated m6A Modification Stabilizes PDIA3P1 and Promotes Tumor Progression Driven by Histone Lactylation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.

中文標(biāo)題:WTAP介導(dǎo)的m6A修飾穩(wěn)定PDIA3P1,并促進(jìn)組蛋白乳酸化誘導(dǎo)的食管鱗癌腫瘤發(fā)展

發(fā)表期刊: Advanced Science

中科院分區(qū)1區(qū)

影響因子:14.1

發(fā)表時間:2025年6月

合作單位:皖南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院

運用產(chǎn)品:生物素RNA pull-down試劑盒F2-RNA pull-down試劑盒由輝駿生物提供產(chǎn)品和技術(shù)支持



【研究概述】:

        2025年6月,皖南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院的研究人員使用輝駿生物生物素RNA pull-down試劑盒F2-RNA pull down試劑盒發(fā)表文章,該研究發(fā)現(xiàn)lncRNA“PDIA3P1在食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)中高表達(dá),通過調(diào)節(jié)糖酵解產(chǎn)生更多的乳酸,上調(diào)乳酸化水平以驅(qū)動腫瘤進(jìn)展。機(jī)制研究表明,lncRNA PDIA3P1通過與miR-152-3p競爭結(jié)合,阻止GLUT1 mRNA的降解來增強(qiáng)其水平,并破壞MARCH8(膜相關(guān)的RING-CH8)和HK2(己糖激酶2)之間的結(jié)合,以減少HK2的泛素化降解,促進(jìn)糖酵解。PDIA3P1還上調(diào)了組蛋白H4K8乳?;℉4K81a)的水平并促進(jìn)BMP7(骨形態(tài)發(fā)生蛋白7)轉(zhuǎn)錄,最終推動ESCC進(jìn)展。此外,Wilms腫瘤1相關(guān)蛋白(WTAP)介導(dǎo)的m6A修飾通過IGF2BP1(胰島素樣生長因子2 mRNA結(jié)合蛋白1)依賴性識別增強(qiáng)了PDIA3P1的穩(wěn)定性。這些發(fā)現(xiàn)揭示了PDIA3P1對糖酵解-H4K81a-BMP7信號軸的調(diào)控在ESCC進(jìn)展中的關(guān)鍵作用,并為代謝重編程和表觀遺傳調(diào)控之間的相互作用提供了新的見解。


【研究內(nèi)容】:

1. 研究發(fā)現(xiàn)lncRNA“PDIA3P1”在ESCC組織及細(xì)胞系中高表達(dá)。RNA-seq結(jié)果揭示其與糖酵解相關(guān)。

2. 生物信息學(xué)分析了靶向PDIA3P1的5種miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR實驗證實miR-152-3p的富集最為顯著,研究者使用輝駿生物“生物素RNA pull-down試劑盒”進(jìn)行miRNA pull-down實驗,發(fā)現(xiàn)PDIA3P1可以結(jié)合miR-152-3p(圖1K)。

3. 進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)PDIA3P1敲低顯著下調(diào)了糖酵解關(guān)鍵酶:葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白1(GLUT1)和己糖激酶2(HK2)的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶點。

4. 機(jī)制解析表明,一方面,PDIA3P1通過結(jié)合miR-152-3p,減少其對GLUT1 mRNA的降解,從而維持GLUT1的穩(wěn)定性和表達(dá)水平。另一方面,PDIA3P1直接結(jié)合HK2,阻斷E3泛素連接酶MARCH8對HK2的泛素化降解,提高其蛋白穩(wěn)定性。這兩方面共同激活了糖酵解關(guān)鍵節(jié)點,加速了乳酸的積累。

5. CUT&Tag和RNA-seq實驗篩選出了H4K8la的潛在靶基因BMP7(骨形態(tài)發(fā)生蛋白7),功能驗證實驗發(fā)現(xiàn),BMP7是PDIA3P1驅(qū)動ESCC進(jìn)展的下游靶點,調(diào)控ESCC的腫瘤進(jìn)展;

6. 此前研究發(fā)現(xiàn)其他癌癥中PDIA3P1出現(xiàn)了大量的m6A富集峰;SRAMP預(yù)測、MeRIP-qPCR顯示、TCGA數(shù)據(jù)庫分析、qRT-PCR實驗發(fā)現(xiàn)PDIA3P1在ESCC中存在顯著的m6A修飾,并且其表達(dá)水平與m6A甲基轉(zhuǎn)移酶WTAP呈正相關(guān);

7. 研究者使用輝駿生物“F2-RNA pull down試劑盒”證實,PDIA3P1與WTAP之間存在直接相互作用(圖2H,I),WTAP通過m6A修飾調(diào)控PDIA3P1的RNA穩(wěn)定性,且m6A閱讀器IGF2BP1是穩(wěn)定PDIA3P1的關(guān)鍵因子,WTAP/IGF2BP1依賴的m6A修飾是PDIA3P1高表達(dá)的關(guān)鍵機(jī)制。

 

【研究結(jié)論】:

綜上所述,本研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作為代謝-表觀調(diào)控樞紐的重要功能:一方面通過ceRNA機(jī)制和蛋白互作增強(qiáng)糖酵解,誘導(dǎo)乳酸依賴的組蛋白乳?;龠M(jìn)BMP7轉(zhuǎn)錄;另一方面通過WTAP/IGF2BP1介導(dǎo)的m6A修飾維持自身穩(wěn)定性和表達(dá)水平。這一發(fā)現(xiàn)不僅拓展了對ESCC發(fā)病機(jī)制的認(rèn)識,也為靶向代謝重編程與表觀修飾的聯(lián)合治療策略提供了新靶點。

 

輝駿生物,10年專注科研實驗,專業(yè)提供全方位蛋白/核酸互作蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)分子/細(xì)胞生物學(xué)等科研產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)。輝駿自有蛋白質(zhì)檢測平臺,對互作產(chǎn)物等微量蛋白的質(zhì)譜鑒定有充足的把控能力,對后續(xù)的生物信息分析有獨到的見解。


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