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用于基因同種型分析的全長轉(zhuǎn)錄組測序

用于基因同種型分析的全長轉(zhuǎn)錄組測序

現(xiàn)在測序技術(shù)已經(jīng)發(fā)展到可以很快以比以前更低的成本為更廣泛的生物(包括單細(xì)胞真核生物)生成高質(zhì)量的基因組參考和轉(zhuǎn)錄組注釋的地步。 雖然基因組將很快組裝成具有合理可靠性的染色體規(guī)模支架,但技術(shù)限制阻止轉(zhuǎn)錄組注釋技術(shù)識(shí)別從這些染色體表達(dá)的基因和同種型。

2021-12-10 09:39:25

科學(xué)家確定了轉(zhuǎn)錄凝聚物的RNA介導(dǎo)的反饋控制

科學(xué)家確定了轉(zhuǎn)錄凝聚物的RNA介導(dǎo)的反饋控制

在一項(xiàng)新研究中,研究人員發(fā)現(xiàn)RNA分子通過反饋回路調(diào)節(jié)自身的形成。當(dāng)RNA分子太少時(shí),細(xì)胞會(huì)啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄以產(chǎn)生更多的RNA分子。然而,在某個(gè)閾值下,過多的RNA分子會(huì)導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄停止。

2021-12-09 15:50:50

揭示致癌能力:為什么有些細(xì)胞會(huì)導(dǎo)致癌癥

揭示致癌能力:為什么有些細(xì)胞會(huì)導(dǎo)致癌癥

使用斑馬魚和人類多能干細(xì)胞癌癥模型,研究表明并非所有具有基因突變的細(xì)胞都會(huì)癌變。 此外,細(xì)胞環(huán)境和內(nèi)在轉(zhuǎn)錄程序與基因突變合作,使細(xì)胞能夠形成癌癥——這一過程被稱為“致癌能力”。 最后,控制細(xì)胞中哪些基因被開啟為治療癌癥提供了潛在的機(jī)會(huì)。除了黑色素瘤之外,每種類型的腫瘤的具體因素組合可能不同。 對調(diào)節(jié)其表達(dá)的機(jī)制的進(jìn)一步研究開辟了治療靶向能力因子的可能性。

2021-09-09 10:56:31

Nature:新型的蛋白質(zhì)折疊促進(jìn)因子DAXX

Nature:新型的蛋白質(zhì)折疊促進(jìn)因子DAXX

研究人員發(fā)現(xiàn)DAXX,一種多聚天冬氨酸/谷氨酸(polyD/E)蛋白,涉及不同的細(xì)胞過程,并擁有幾種蛋白質(zhì)折疊的活性。DAXX防止聚集,溶解預(yù)先存在的聚集物,并解開模型底物和神經(jīng)變性相關(guān)蛋白的錯(cuò)誤折疊蛋白。

2021-08-24 11:18:08

RNA修飾在癌癥發(fā)生和進(jìn)展中的作用

RNA修飾在癌癥發(fā)生和進(jìn)展中的作用

在這篇綜述中,研究人員揭示了參與癌癥的 RNA 的表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)途徑,并描述了其生物學(xué)功能及其與疾病的關(guān)系。

2021-08-17 11:20:07

Nature | 單堿基高分辨率革新技術(shù)MCC,可用于堿基對層面的基因互作研究

Nature | 單堿基高分辨率革新技術(shù)MCC,可用于堿基對層面的基因互作研究

研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種監(jiān)測基因組3D結(jié)構(gòu)的方法,能在DNA單堿基對水平上精準(zhǔn)定位基因組內(nèi)的DNA互作,為基因表達(dá)、調(diào)控的研究提供了新思路,也為未來的基因組3D研究開辟了無限可能。

2021-07-03 11:21:07

《自然-方法學(xué)》:首次揭示溶酶體的代謝特征

《自然-方法學(xué)》:首次揭示溶酶體的代謝特征

中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)部熊偉教授與倉春蕾教授課題組完成了單個(gè)溶酶體的代謝組學(xué)分析,并深度探索了細(xì)胞衰老過程中溶酶體代謝組學(xué)的異質(zhì)性改變。

2021-06-22 11:22:25

Plant Cell:一種在植物細(xì)胞中研究蛋白互作的新方法

Plant Cell:一種在植物細(xì)胞中研究蛋白互作的新方法

在眾多的PPI研究方法中,通常將蛋白質(zhì)分為誘餌蛋白與獵物蛋白,利用酵母的生長(Y2H),觀察活體細(xì)胞中的熒光(熒光能量轉(zhuǎn)移,F(xiàn)luorescence Resonance Energy Transfer,F(xiàn)RET或雙分子熒光互補(bǔ),Bimolecular Fluorescent Complementation,BiFC)以及采用各類體內(nèi)與體外的沉淀法(免疫沉淀或親和純化等)等方法,

2021-05-07 11:23:26

Nature: 第一個(gè)完整的常染色體的結(jié)構(gòu)、功能和進(jìn)化

Nature: 第一個(gè)完整的常染色體的結(jié)構(gòu)、功能和進(jìn)化

日前,美國華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院Evan E. Eichler小組在《自然》揭示了人完整8號(hào)染色體的結(jié)構(gòu)、功能和進(jìn)化關(guān)系。

2021-04-13 11:24:47

最小基因組的人造生物,終于學(xué)會(huì)細(xì)胞分裂和產(chǎn)生一氧化氮

最小基因組的人造生物,終于學(xué)會(huì)細(xì)胞分裂和產(chǎn)生一氧化氮

2021年3月30日,頂尖學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》在線發(fā)表了一篇論文,對這種人造生物進(jìn)行了優(yōu)化,讓它能夠類似正常細(xì)胞般分裂?!犊茖W(xué)》雜志同日也刊發(fā)新聞報(bào)道這個(gè)發(fā)現(xiàn),提到這又是一個(gè)重要的進(jìn)展。

2021-03-31 11:25:51

METTL14介導(dǎo)的SOX4 m6A修飾抑制結(jié)直腸癌腫瘤轉(zhuǎn)移

METTL14介導(dǎo)的SOX4 m6A修飾抑制結(jié)直腸癌腫瘤轉(zhuǎn)移

結(jié)直腸癌(CRC)的主要死亡原因是遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白14(METTL14)是一種主要的RNA N6-腺苷甲基轉(zhuǎn)移酶,通過調(diào)節(jié)RNA功能參與腫瘤發(fā)展。本研究旨在揭示METTL14在CRC中的生物學(xué)功能及其分子機(jī)制

2021-03-24 11:30:45

lncRNA編碼蛋白SMIM30激活MAPK通路促進(jìn)肝癌發(fā)生

lncRNA編碼蛋白SMIM30激活MAPK通路促進(jìn)肝癌發(fā)生

雖然lncRNA最早被認(rèn)為是一種非編碼RNA,但近年來越來越多的證據(jù)表明,一些lncRNA含有小的開放閱讀框(SmORF),并且其編碼的小肽具有生物學(xué)功能。

2021-01-26 11:26:53

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